O CAE é composto pelo Pró-Reitor de Assuntos Estudantis, os diretores acadêmicos e representantes dos docentes, discentes e técnicos-administrativos. É o único conselho com paridade, tendo 8 vagas para docentes e 8 para discentes, além dos alunos de pós e residentes. O CAE é responsável pelo apoio psicopedagógico e social aos estudantes, promover políticas e programas culturais direcionadas aos estudantes e é um dos espaços fundamentais na luta por uma permanência estudantil capaz de assegurar as condições essenciais para que os estudantes se integrem por completo na universidade, como os auxílios financeiros, os restaurantes universitários, as moradias estudantis e o acompanhamento de saúde.